日本东京知名的大学包括：

东京大学：

作为日本最古老、历史悠久的综合性大学之一，东京大学在世界范围内享有很高的声誉，拥有众多知名的校友和教授。它成立于1877年，是日本第一所国立大学，也是七所旧帝国大学之首。

早稻田大学：

早稻田大学是一所日本著名的私立综合性大学，成立于1882年，以商科、文科等领域的高学术水平著称。它位于日本东京都新宿区，是日本历史最悠久的综合学术机构之一。

明治大学：

明治大学成立于1881年，是一所历史悠久的私立综合性大学，在工程、法学、心理学等领域有较高的声誉。它位于日本东京都，总学生人数超过4万人。

东京工业大学：

专注于理工科研究和教育，东京工业大学在工程、材料科学等领域具有国际影响力。它有三个校区，主校区在东京的目黑区。

庆应义塾大学：

庆应义塾大学是一所世界著名的研究型综合大学，有“亚洲第一私立学府”之称。它位于日本东京都中心，主校区在东京稻户市。

一桥大学：

一桥大学是一所专注于社会科学的顶尖私立大学，在商学、法学等领域有很高的学术水平。

东京外国语大学：

东京外国语大学是一所专注于语言教育的顶尖公立大学，提供多种语言课程。

东京医科齿科大学：

东京医科齿科大学是一所专注于医学和齿科教育的顶尖公立大学。

上智大学：

上智大学是一所私立综合性大学，以国际交流和多元文化著称。

东京艺术大学：

东京艺术大学是一所专注于艺术教育的顶尖公立大学。

东京理科大学：

东京理科大学是一所专注于理工科教育的顶尖公立大学。

御茶水女子大学：

御茶水女子大学是一所专注于女性教育的顶尖公立大学。

首都大学东京：

首都大学东京是一所综合性国立大学，位于日本东京都。

中央大学：

中央大学是一所私立综合性大学，在多个学科领域有较高的学术水平。

这些大学在日本乃至全球都享有很高的声誉，吸引了大量国内外优秀学生和学者。建议根据个人兴趣和学术目标选择合适的大学进行申请。