河南历史上曾拒绝过以下大学的迁入：

1.  中国科学技术大学：中科大曾考虑搬迁至河南，但最终被合肥接受。

2.  中国矿业大学：中国矿业大学也曾被提议搬迁至河南，但最终没有成行。

3.  中国地质大学：中国地质大学同样被提议搬迁至河南，但计划最终没有实现。

4.  对外经济贸易大学：对外经贸大学也曾考虑搬迁至河南，但后来选择其他地点。

综上所述，河南历史上拒绝了包括中国科学技术大学、中国矿业大学、中国地质大学和对外经济贸易大学等多所知名高校的迁入请求。