高考日语考生在选择专业时，需要注意以下限制：

军事、国防和公共安全等特殊专业：

这些专业对统考外语语种有限制，日语考生不能报考此类特殊专业。根据教育部的规定，除军事、国防和公共安全等部分特殊院校（专业）外，高校不得对报考非外国语言文学类专业的考生作统考外语语种限制。

其他语言类专业（除日语外）：

部分学校的外语专业对日语有限制，日语考生不能报除日语以外的其他语言类专业。例如，山东师范大学规定英语（公费师范生）、外国语言文学类（英语）只招收英语语种考生，其余各专业（类）不限制外语语种。

国际贸易类专业（主攻英语方向）：

一些学校不接受日语考生；部分招收日语考生的学校，由于英语在课程学习中占重要部分，对英语要求很高，对于一直学习日语的考生而言比较吃力。

部分与英语相关性强的专业：

计算机、软件、翻译、对外经贸等专业，有些大学会限制英语语种，日语考生需要谨慎报考。

中外合作办学类专业：

极少数情况只招收英语考生，大部分虽不做要求，但招生简章中会提醒小语种考生谨慎报考。

部分院校英语专业：

英语教育、翻译等英语相关专业可能对英语的要求会高一些，但并不意味着不能选这些专业，很多学校都提供英语强化课程，或者可以在大学期间再努力提升英语水平。

艺术类专业：

如音乐、美术等专业，一般不允许选择日语作为外语。

综上所述，高考日语考生在选择专业时，主要需要避开军事、国防和公共安全等特殊专业，以及其他语言类专业和与英语相关性强的专业。建议考生在报考前仔细查阅所填报高校的《招生章程》，了解具体的限制和要求。