扬州大学拥有丰富的博硕学位点，具体包括：

一级学科博士学位授权点：

21个。

博士专业学位类别：

3个。

一级学科硕士学位授权点：

50个。

硕士专业学位类别：

34个。

博士后流动站：

22个。

此外，扬州大学的优势学科包括兽医学，该学科在全国高校中被评为A-，位列前列。汉语言文学、农学、植物保护学、畜牧兽医学也是学校的重点研究方向。专业硕士中，会计硕士专业学位（MPAcc）着重培养具有良好职业道德、国际视野和创新意识的高素质应用型会计专门人才。