高三会考缺席会导致一系列负面影响，具体包括：

成绩影响

缺考会导致该科目的成绩记为零分。

如果多科目缺考，整体成绩将受到严重影响，可能会影响升学。

升学影响

会考成绩是入学考试的重要参考指标，缺考可能会在升学时对学生产生不利影响。

某些高校可能会对会考成绩不佳的学生在招生时进行限制或拒绝录取。

未通过会考的学生可能无法获得高中毕业证书，进而无法以普通高中毕业生的身份参加高考，失去进入大学的机会。

学业经验

缺考会减少学生的考试经验和大学生活经验，错过锻炼和提高自己的机会。

毕业证问题

在一些情况下，如果学生缺考导致未能通过会考，可能无法获得高中毕业证，只能获得高中结业证。

法律层面

缺考属于个人行为，但可能导致无法获得该科目成绩或需再次参加考试。

补救措施

学校可能会给予宽限期，允许学生在一定时间内完成缺考科目的补考或其他学术要求。

如果因不可抗力原因缺考，学生需要在24小时内向校方提供相关证明材料，可能有机会安排一次补考（Deferred考试）。

综上所述，高三会考缺席会对学生的成绩、升学、学业经验、毕业证获取以及法律层面产生严重的负面影响。因此，建议学生认真对待会考，尽力参加考试，以避免这些不利后果。如果确实遇到不可抗力原因缺考，应及时向校方提供相关证明，争取补考机会。