国内动画专业硕士排名如下：

北京师范大学

中国传媒大学

中央戏剧学院

北京电影学院

清华大学

中央美术学院

武汉理工大学

四川美术学院

南京艺术学院

同济大学

中国美术学院

江南大学

浙江理工大学

上海戏剧学院

中国戏曲学院

上海大学

这些排名基于不同的来源和评估标准，可能会有所变动。建议在选择学校时，综合考虑学校的教学质量、师资力量、科研水平以及个人兴趣和发展方向。