木房子升高三米的方法有以下几种：

增加楼层

直接在原楼顶上增加一层或多层，以提高房屋的高度。这通常需要进行结构计算和加固设计，以保证新加层的安全性和与现有结构的协调性。

改变屋顶形式

通过改变屋顶的形式，如从坡屋顶改为平屋顶，或在平屋顶上增设露台或花园，可以增加房屋的可利用空间并提升其美观度。

换顶加高

拆除原有屋顶后重新施工，并在新屋顶上增加建筑高度，适合于旧房的改造。这种方式可以提高整体高度，改进屋顶结构和保温性能。

整体抬高木结构房屋

使用千斤顶和液压设备逐步抬高房屋，并在下面加固石头或混凝土，确保整体平衡性。这种方法需要专业知识和设备支持，并且要确保整体平衡性，避免影响结构安全。

挑高房屋

拆除天花板并重新安装来增加层高，通常用于室内装修。这样可以提高通风和采光效果，同时增加空间感。

加高木板墙

可以选择用砖砌到顶，或者加方木龙骨和外侧木板。如果是在设计阶段，可以使用设计软件（如酷家乐）来调整墙体高度，并相应地调整相邻物品的位置和大小。

加厚地板底层

在地板下面加入一层厚度相同的木材板，然后将原有地板覆盖其上，从而达到升高的目的。

加垫脚

在地板的底部四周加高脚垫或者小木块，这样可以增加地板的高度。

使用加高基层

在地板底层使用高密度基层，可以让地板整体高出一些。

将地板撬起后重新安装

将地板撬起后重新安装，确保加厚的木板或者垫脚的高度与原有地板的高度相差不大，以免影响地板的平整度和舒适度。

安装木龙骨并整体抬高

根据设计要求，在地面上安装木龙骨，并将木龙骨按照一定的间距平行排列，用螺丝钉固定在地面上。在木龙骨上安装木板，并将整体抬高到所需的高度。

这些方法各有优缺点，可以根据具体情况和需求选择合适的方法。如果需要较高的精度和稳定性，建议采用安装木龙骨并整体抬高的方法。如果只是轻微增高，加垫脚或加厚地板底层可能更为简单和实用。