高考指南中没有军校的原因主要有以下几点：

教育体系差异：

军校不在国民教育体系内，因此不在教育部公布的高校名单上。

特殊性和机密性：

军校具有高度的特殊性和机密性，其专业设置和科研项目往往涉及国家机密，不能对外公开。

培养目标不同：

军校专门培养军队人才，而普通大学则主要面向民间，为国防事业提供人才的方式与军校不同。

信息不透明：

军校没有像其他高校那样的信息公开平台，如微博、公众号等，因此不参与高校排名。

专业设置：

军事类专业通常由专门的军队院校负责，普通大学一般不会设置军事学专业。

综上所述，高考指南中没有军校是因为军校的教育体系、特殊性和机密性、培养目标、信息透明度以及专业设置等方面的特殊性，导致其不在普通高校的信息发布和排名范围内。