日本高考使用铅笔的原因主要有以下几点：

方便修改：

铅笔写错了可以方便地擦掉，这对于需要修改答案的考试来说非常重要。相比之下，使用钢笔或圆珠笔一旦写错，修改起来比较困难。

考试文具没有硬性规定：

日本对考试答题文具一般不做硬性规定，如果有限制也会注明。因此，学生可以根据自己的习惯选择使用铅笔或其他文具。

自动铅笔的普及：

日本自动铅笔制作精良，如SHARP等品牌非常受欢迎，自动铅笔的使用也非常普遍。自动铅笔可以方便地更换笔芯，适合长时间书写和修改。

环保考虑：

虽然木制的铅笔不再广泛使用，但自动铅笔和圆珠笔的使用相对环保，符合现代环保理念。

考试要求：

有些考试，特别是大学入试，可能会对铅笔的使用有特定要求，例如为了防止磁带读取机读取错误，可能会要求使用铅笔填写答案。

综上所述，日本高考使用铅笔主要是出于方便修改、没有硬性规定、自动铅笔的普及、环保考虑以及特定考试要求等多方面的原因。