参军时填写高考分数的主要原因是为了 作为初步筛选的依据。在女兵招募过程中，高考成绩是一个重要的参考指标。具体来说，女兵报名需要高考成绩，并且需要达到一定的分数线。报名截止后，网上报名系统会根据报名应征人员的高考分数计算出高考相对分进行排序，择优选择初选预征对象。

此外，高考成绩还可以作为后期综合考评的一部分，以确保选拔出高素质的女兵。在填写高考分数时，应征者应如实填写自己的高考成绩，包括加分项（如政策加分、体育特长加分等），以保证所填写的信息真实有效。

因此，参军时填写高考分数是为了确保选拔过程的公平性和准确性，通过初步筛选和后期综合考评，选出最适合的女兵。建议应征者在填写高考分数时，仔细核对数据，确保信息的真实性和准确性。