高考有争议分数的原因主要有以下几点：

教育水平与经济状况的差异

全国的教育水平与经济状况相辅相成，如果全国一张卷、统一一个分数线，势必会加剧教育的不平衡，进而影响经济社会的进步，而且会拉大贫富差距。

区域协调发展的需要

以省、自治区、直辖市为单位划定分数线，有利于促进区域协调发展，逐步缩小与发达地区的差距，体现社会主义制度的优越性。

教育资源分布不均

各地高校教育资源不同，大部分高校都有招生本地生源数量较多的政策，高校众多的地方，则本地考生的招生名额也会较多。此外，各地考生数量也不同，如河南省、广东省、山东等地考生多，而北京、上海、西藏等地考生少，各地自行划线可以确保相对合理的录取率。

高考考卷的差异

高考考卷不一样，没有可比性。目前全国有多个省份采用自主命题的形式，这使得不同地区的试卷难度和评分标准存在差异。

地方保护主义

一些省份为了保护本地学生，可能会在阅卷和录取过程中给予本地考生更多的优惠，这导致全国统一分数线的难度加大。

心理因素的影响

高考不仅是知识水平的考察，更是心理素质的考验。许多学生在实际考试中会因为紧张、焦虑而无法发挥出平时的水平。这种压力可能会导致注意力分散，思维混乱，从而影响考试时的表现。

高校特殊分数要求

某些高校可能会设定一些特殊的分数要求，比如特定专业要求达到700分以上才能录取，这也可能导致学生699分的困境。

综上所述，高考有争议分数的原因是多方面的，包括教育水平与经济状况的差异、区域协调发展、教育资源分布不均、高考考卷的差异、地方保护主义以及心理因素等。这些因素共同作用，导致了高考分数的争议。