吉林高考只有两天的主要原因是为了保证高考的公平、公正和科学性。具体来说，吉林省高考采用了“文化课一天、综合素质评价一天”的考试模式，即第一天考试文化课，第二天进行综合素质评价考试。这种考试模式可以更全面、更客观地反映学生的综合素质和能力，有利于高考选拔更多优秀的人才。

此外，吉林省高考只有两天还可以有效地减轻考生和家长的心理和经济压力，避免过长的考试时间对考生身心健康造成不利影响。同时，两天的考试时间也有利于高校招生工作的顺利进行，为高考后的招生录取工作提供更加便利和高效的条件。

另外，也有可能是因为传统高考地区的考试科目较少，通常为三天考完，而吉林省属于传统高考地区，因此只有两天的考试时间。

综上所述，吉林高考只有两天主要是为了更全面、更客观地评估学生的综合素质和能力，减轻考生和家长的压力，并有利于高校招生工作的顺利进行。