清溪镇的高中学校包括：

东莞高级中学（集团）清溪中学：

这所学校创办于1929年，前身为鹿鸣学校，是一所具有深厚历史文化积淀的老校。2020年，东莞高级中学采用“名校+分校”的形式托管清溪中学，增设了高中部。

东莞市海德双语学校：

这是一所新建的民办高中。

东莞市华中师大附属中学：

这也是一所新建的民办高中。

清溪第一中学。

清溪第二中学。

清溪第三中学。

清溪第四中学。

清溪第五中学。

清溪第六中学。

清溪第七中学。

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