高考延时胶卷的惩罚主要包括以下几种情形：

考试结束信号发出后继续答题：

根据《国家教育考试违规处理办法》第五条第三项规定，考试结束信号发出后，考生应当立即停止答题并停笔。如果发现在考场上延迟答题，会作为违规处理，单科成绩记为零分。

携带规定之外的物品进考场：

考生不得携带任何规定之外的物品进入考场，否则将受到相应的处罚。

在试卷上做标记：

在试卷上做标记也是不被允许的行为，可能会被视为对试卷的篡改或损坏，从而受到相应的处理。

将试卷、草纸带出考场：

高考试卷和草纸都属于国家机密文件，考生不得将其带出考场，否则将可能面临严重的后果。

在规定的时间内未完成考试：

如果考生在规定时间内没有完成试卷，监考老师会通知考生离开考场，并将未完成的试卷收回。考生可能会被视为“拖答”，成绩将会被扣除一定的分数。

严重违规情况：

在严重违规情况下，考试机构还可能会对考生做出其他处罚措施，如取消考试成绩，禁止参加未来的考试等。

综上所述，高考延时胶卷的惩罚主要是取消单科成绩，并且可能会面临其他附加的处罚措施，如携带违禁物品、在试卷上做标记等行为也会受到相应的处理。