高考理科分低的原因可以从多个角度进行分析：

学科难度较高

理科通常需要更深入的数学和科学知识，这些知识的学习和掌握需要更多的时间和精力，因此理科的难度相对较高。

招生计划差异

理工科专业的招生人数远超文史类专业，导致文科生竞争激烈，分数自然水涨船高。

社会认知

社会普遍认为文科强于理科，这种认知观念也影响了人们的分数预期，使得文科分数线总体较高。

评价标准不同

文科注重学生的综合素质和思辨能力，而理科注重逻辑思维和计算能力，这导致理科的分数差距可能比文科更明显。

考试形式不同

文科考试中有较多主观题，考生有一定的发挥空间；理科考试多为客观题，得分更为明确。

教学方法差异

理科学习更侧重于实践和实验，而文科学习更侧重于理论，这也影响了学生掌握知识和运用知识的能力。

学科特点

理科涉及到数学、物理、化学等学科，相对而言，学科内容和难度较大，对学生的逻辑思维、数学能力和实验操作能力要求高。

就业市场需求

部分理科专业的就业市场相对较为狭窄，对于一些专业，招生计划比较大，而相对招生人数较小，造成了录取分数线相对较低的情况。

资源配置

一些学校或院系在资源配置上，将重点放在文科或其他专业上，导致理科的招生规模相对较小，录取分数线也相对较低。

学生自身因素

基础知识不扎实、题海战术却无方法、时间分配不合理、运算能力不行、应用能力不够、审题不够细心、答题速度慢等因素也会影响理科生的成绩。

综合以上因素，可以得出结论：高考理科分低的原因是多方面的，包括学科难度、招生计划、社会认知、评价标准、考试形式、教学方法、学科特点、就业市场需求、资源配置以及学生自身的学习方法和能力等。