巴州职业学校（巴音郭楞职业技术学院）的专业设置涵盖了多个学科领域，具体包括以下专业：

电子信息工程学院

电子信息工程技术

计算机网络技术

大数据与会计

电子商务

机械电气工程学院

电气自动化技术

机电设备技术

机械制造及其自动化

工业机器人技术

石油化工学院

应用化工技术

油气开采技术

石油化工技术

油田化学应用技术

人文经济学院

会计

旅游管理

酒店管理

传媒学院

广播影视技术

新闻采编与制作

矿业工程学院

矿山地质与勘查技术

矿业工程技术

油气智能开采技术

继续教育学院

各类成人教育和职业培训

体育学院

休闲体育服务与管理（高尔夫方向）

运动训练

生物工程系

园艺技术

植物保护与检疫技术

园林技术

纺织工程系

现代纺织技术

纺织材料与应用

交通工程系

汽车运用与维修（含3+2）

铁道运输管理（高铁动车乘务方向）

旅游系

旅游服务与管理

酒店管理

基础课教学部

各类基础课程

医学院

医学美容技术

医学检验技术（省级重点专业）

医学影像技术（省级重点专业）

临床医学（国控重点专业）

艺术类专业

音乐表演

这些专业旨在培养具有实践能力、应变能力、创新能力的中、高级实用型技术人才。具体专业设置可能会根据市场需求和产业发展进行调整，正式填报时需要以学校官网公布的数据为准。