大学自主招生存在以下弊端：

实际效果与期望之间存在偏差：

自主招生考试与绝大多数考生没有直接关系，且大规模自主招生联盟的出现使得自主招生笔试更像另一次高考。

机会不均等的不公平竞争：

自主招生被视为给某些人开了一扇后门，容易滋生腐败现象，尤其是在行政管理体制不甚完善的情况下。

高校间争夺生源的乱象：

各大学在自主招生宣传上存在夸大其词、吸引眼球的现象，这些行为与促进中学素质教育的初衷相去甚远。

排他性竞争：

两大联考同盟将考试放在同一天进行，这种排他性的竞争有悖于真正的自主招生，带有垄断竞争的味道。

公平性问题：

自主招生过程中存在公平性问题，包括机会公平、微观层面的考试内容与形式对农村学生的不公平，以及对自主招生监管不够，过程不够透明。

学习负担加重：

不少考生和家长将自主招生视为“捷径”，但实际上需要付出大量时间和精力，影响其他科目的学习。

竞赛与自主招生的冲突：

参加自主招生考试、选拔等活动会占用学生大量时间，影响其他科目的学习，且可能导致学生偏科。

农村考生处于劣势：

自主招生政策在某些方面会加大城乡差距，农村考生在自主招生制度上常常处于劣势。

自主性难以充分发挥：

由于多种原因，大学在招考中的自主性未能充分发挥，选拔缺乏科学性。

腐败现象严重：

自主招生、艺术类招生及补录成为“特招”腐败的重灾区，存在权钱交易等现象。

信息不对称：

自主招生的信息发布渠道相对有限，一些学生可能因家庭背景、地域等因素无法及时获取准确的招生信息，导致在报名和考试过程中处于劣势。

学习态度问题：

自主招生的学生可能缺乏统招学生的学习态度，只是单纯地比较聪明，缺乏认真学习的态度。

综上所述，大学自主招生虽然旨在选拔创新人才，但在实际操作中存在诸多弊端，需要进一步完善和改进。