重庆巴蜀中学在自主招生考试中通常会考察以下科目：

1. 语文

2. 数学

3. 英语

4. 物理

5. 化学

6. 生物

7. 政治

8. 历史

9. 地理

这些科目涵盖了理科和文科的主要学科内容。理科生可能在数学方面会有特定的选修内容，与文科生有所不同。

此外，2016年学校自主招生的考试形式一般为“文化联考+综合素养测试”相结合的考试模式。文化联考包括语数英三门科目；综合素质测试分为上机测试和面试，上机测试在计算机上答题，考核学生人文素养；面试由面试员与考生交流，主要考核语言表达、心理素质、反应能力、知识面、职业倾向等基本职业素质。

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