高考设置甲卷的原因主要有以下几点：

适应不同层次的学生需求

甲卷主要针对学习成绩优秀的考生，难度相对较高，能够更好地挑战这些学生，发挥他们的优势。

乙卷则适用于一般考生，难度适中，符合他们的学习水平。

丙卷针对学习成绩较弱的学生，难度较低，帮助他们更好地发挥自己的潜力。

保证考试的公平性

由于不同地区、不同学校的教育资源和学生水平存在差异，采用甲卷、乙卷和丙卷可以更好地适应这些差异，避免因难度过高或过低而导致的不公平现象。

分卷考试可以让评分更加准确，因为评分者可以根据学生回答的题目类型和难度进行更合理的评分。

提高命题质量

分卷考试可以减轻命题的难度，使命题更加科学、公正、合理。

由国家教育部门统一命题，专家力量更强，但依照同样的考试大纲出多份卷，可以确保试卷的质量和难度的一致性。

便于考生发挥优势

不同的考生对不同的考题有不同的理解程度和喜好，分卷考试可以让考生更好地发挥自己的优势，取得更好的分数。

综上所述，高考设置甲卷是为了更好地适应不同层次学生的需求，保证考试的公平性，提高命题质量，并便于考生发挥自己的优势。