高中生物中常用的菌种包括：

细菌

大肠杆菌：常用于实验和作为益生菌。

乳酸菌：用于制作酸奶和泡菜，厌氧型。

链球菌：一般厌氧型。

葡萄球菌：常见细菌，可引起感染。

醋酸杆菌：进行有氧呼吸产生醋酸。

硝化细菌：自养需氧，参与氮循环。

固氮菌：如根瘤菌和圆褐固氮菌，能固定氮气。

放线菌

链霉素等抗生素的产生菌。

真菌

酵母菌：兼性厌氧菌，用于酿酒和面包制作。

霉菌：如青霉、毛霉、曲霉，用于发酵工业。

蘑菇：如香菇、平菇、草菇、口菇等。

蓝细菌

蓝藻：能进行光合作用，如颤藻、发菜等。

这些菌种在高中生物教材中经常被提及，并在实验和实际应用中具有重要意义。建议学生熟悉这些菌种的基本特性和应用，以便更好地理解和掌握生物学知识。