根据2025年的最新排名数据，合肥市的主要大学排名如下：

中国科学技术大学：全国排名第3，稳居合肥市及安徽省第一。

合肥工业大学：全国排名第54，位居合肥市第二。

安徽大学：全国排名第81，位列合肥市第三。

安徽医科大学：全国排名第139，位居合肥市第四。

安徽农业大学：全国排名第157，位列合肥市第五。

合肥大学：全国排名第216，位居合肥市第六。

安徽中医药大学：全国排名第263，位列合肥市第七。

安徽建筑大学：全国排名第271，位居合肥市第八。

合肥师范学院：全国排名第365，位列合肥市第九。

巢湖学院：全国排名第373，位居合肥市第十。

此外，合肥市还有一些民办大学和专科院校，如安徽新华学院、合肥职业技术学院等，也在各自的领域内表现突出。

以上排名数据来源于多个权威榜单，包括校友会、软科和ABC中国大学排名。