合肥高考考两天的主要原因是因为 新高考地区和传统高考地区的区别。具体来说：

新高考地区：

实行3+1+2的考试模式，通常第1天考语文和数学，第2天考英语和必考科目，第3天考选考科目。因此，在新高考地区，高考时间为三天。

传统高考地区：

实行3+X模式，通常第1天考语文和数学，第2天考外语和文科综合或理科综合。因此，在传统高考地区，高考时间为两天。

综上所述，合肥高考考两天是因为新高考地区和传统高考地区的区别，传统高考地区通常只有两天考试时间。