深圳高考退档率高的原因主要有以下几点：

政策性落榜：

高校招生实行按比例投档的办法，全省批次省控线是按1:1.2比例划出，各个招生院校在录取中实行1:1.05—1:1.2投档比例，这种录取政策意味着考生达线未必被录取，也就是说上线考生存在5%到20%的虚额。一般在省控线30分以内的“边缘生”报考时需要格外谨慎。

档案材料填写有疑问：

填写错误或作假，如字迹不清楚、志愿顺序填写不规范、材料不真实客观等，都可能导致退档。

身体条件不符合所报院校或所选专业的标准：

如身高、听力、色弱、色盲、肢体、口吃、性别等不符合要求，这些都会导致退档。

所报专业相关科目成绩偏低：

许多高校招生不仅要求总分达到录取分数线，而且对所报专业相关科目的成绩也有一定的要求，如外语专业的英语成绩要达到100分，汉语言文学专业的语文成绩要达到90分等。

不服从专业调剂：

考生在填报志愿时，若所报专业均已满额且未勾选服从调剂选项，学校无法调剂安排专业，只能退档。

提档比例造成的退档：

各院校的提档比例并不统一，有的院校提档比例为1:1.05甚至1:1.1，这意味着即使考生过了投档线，也可能因为排名靠后而被退档。

体检不合格或报考专业受限：

如视力、身高、体重等身体条件不符合要求，或者考生体检不合格，都会导致退档。

户籍地无招生计划：

部分特殊招生计划是面向特定地区投放的，如果考生户籍不在该计划投放的地区，即使分数达标也会被退档。

诚信记录问题：

如果考生在上一年高考中存在“被录取未报到”的情况，会留下不诚信记录，这也可能导致退档。

综上所述，深圳高考退档率高主要是由于政策性落榜、档案材料填写问题、身体条件不符合要求、专业成绩不达标、不服从专业调剂、提档比例、体检不合格、户籍地无招生计划以及诚信记录等多方面因素共同作用的结果。建议考生在填报志愿时，务必仔细阅读招生章程，了解相关政策和要求，合理选择专业，并勾选服从调剂选项，以降低退档风险。