福建高考取消三本的主要原因包括：

合并录取批次：

为了提高本科教育质量和实现高等教育分类管理，教育部门将二本和三本高校合并录取批次。这一改革使得原先的三本院校得以与二本院校在同一个批次进行招生，从而实现了更大范围、更深层次、更本质性的相互选择。

提高教育质量：

三本院校的教学生源主要来自于高考落榜生和重点院校未被录取的学生，这些学生的学业和学科素养相对较弱。取消三本录取有助于提高本科教育的教学质量和办学水平，提升毕业生的能力和竞争力。

促进平等竞争：

分批次录取人为地将高校分为不同等级，不利于高校之间的平等竞争。取消三本录取后，所有高校在招生时处于同一层次，有助于打破高校之间的层级壁垒，促进不同层次大学之间的平等竞争。

减少学历歧视：

批次合并后，招生和用人环节不再区分一本、二本和三本，从而减少了学历歧视现象，使得所有本科毕业生在就业时享有平等的待遇和机会。

优化高等教育结构：

取消三本录取有助于优化高等教育结构，使得高等教育更加贴近市场需求，更加实用。

综上所述，取消三本录取批次是为了提高教育质量、促进高校平等竞争和减少学历歧视，这一改革有助于优化高等教育结构，提升教育公平性。虽然三本院校在名称上可能仍然存在，但其招生和录取方式已经与二本院校合并，不再作为独立的一个批次进行。