今年高考只考两天的主要原因包括：

疫情影响：

近年来，高考受到疫情的影响较大，为了减少人员聚集和降低感染风险，将高考分为两天进行可以有效缩短考试时间，缓解学生的考试压力，并有利于防疫和管理，保障考生的身体健康。

考试安排：

高考的考试时间长短由当地教育部门根据实际情况和考试安排决定。在传统高考地区，一般采用“3+X”模式，即第一天考语文和数学，第二天考外语和文科综合或理科综合，因此只需要两天时间。而在新高考地区，实行“3+1+2”的考试模式，通常需要三天时间来完成所有科目的考试。

保障考生健康：

将高考分为两天进行，能够保证考生有足够的休息时间，避免因连续考试数小时而导致的疲劳和失误，从而有利于提高考试成绩和保证考试的公正性。

综上所述，今年高考只考两天主要是为了应对疫情挑战，缓解考生压力，保障考试安全，并在保证考试质量的前提下，合理安排考试时间。