新高考专业投档选科主要遵循以下规则：

分数优先：

所有考生按照高考总分从高到低进行排序，分数高的考生优先进行投档。

遵循志愿：

考生所填报的院校专业组具有逻辑顺序，计算机按照考生填报的顺序依次检索。考生应将最想上的学校和专业放在志愿序列的前面，以增加被录取的机会。

一轮投档：

在正式投档前，省考试院会进行多次模拟投档，以确保无误。平行志愿中，考生可以在同一批次内填报多个院校志愿，且每个志愿之间没有优先级顺序。录取时，将考生按成绩从高分到低分排序，依次检索考生填报的平行志愿。如果考生的分数符合某个志愿的学校要求，则被该学校录取；如果分数不够，则继续检索下一个志愿，依此类推。

专业调剂：

服从调剂从在高校同一科类招生专业范围内进行调剂变为只能在同一院校专业组的招生专业范围内进行调剂，不能调剂到其他院校专业组。

特殊类别投档规则：

艺术类、提前本科批次、本科批次、提前高职（专科）批次等都有各自的投档规则。例如，艺术类提前本科批次按单志愿投档录取，本科批次按平行志愿投档，提前高职（专科）批次将专业及文化成绩均达到高职（专科）相关专业类分数线、填报了相关高校志愿的考生档案全部投出，由高校依据学校公布的录取规则择优录取。

选科与专业的对应关系：

选科与高考填报专业有着紧密的联系。一般来说，确定的选考科目应既有利于专业选择范围的扩大，又有利于提高总分。例如，物理类选科组合“物理+化学+生物”适应范围广泛，几乎覆盖理工农医学专业，以及部分文科类专业。

特殊类别：

对于特殊类别的考生，如选考特定科目组合的考生，可能会享有优先投档或其他优惠政策，具体规则需参照各高校和省份的招生政策。

综上所述，新高考专业投档选科主要依据高考总分、考生志愿顺序、专业调剂规则以及特殊类别的投档规则。建议考生在选科时，结合自身兴趣和职业规划，选择有利于未来专业选择的科目组合，并关注各高校的具体招生细则和要求。