根据相关参考资料，西藏自治区内的本科院校排名如下（截至2025年最新信息）：

西藏大学

综合实力：西藏自治区唯一的国家“211工程”高校和“双一流”建设高校，综合实力稳居西藏第一。

学科特色：涵盖文、理、工、医等多学科，民族学、教育学、中国语言文学等专业较为突出。

地理位置：主校区位于拉萨市。

西藏民族大学

综合实力：排名西藏第二，前身为西藏公学，具有深厚的历史底蕴。

学科特色：以人文社科为主，法学、管理学等学科具有优势。

地理位置：实际校址位于陕西省咸阳市，属于西藏自治区管理的高校。

西藏农牧学院

综合实力：西藏农林类重点高校，以农学、林学、水利工程等学科为特色。

地理位置：位于林芝市。

西藏藏医药大学

综合实力：全国唯一独立设置的藏医药高等院校，藏医学、藏药学等专业具有独特优势。

地理位置：位于拉萨市。

补充说明：

关于“重本”概念：目前教育部已取消本科一批次、二批次的明确划分，西藏大学作为“双一流”高校，通常被认为是西藏自治区内综合实力最强的本科院校。

报考建议：选择院校时需结合学科特色和地理位置。例如，西藏民族大学虽属西藏自治区，但校址在陕西咸阳，适合对人文社科感兴趣的学生。

参考资料：

西藏大学是几本院校?

2025年西藏本科院校排名

2024年西藏本科大学排名

2024西藏重点大学名单

西藏本科大学名单及排名

2025西藏自治区大学排名