三本学校学费贵的原因主要有以下几点：

资金来源不足 ：三本大学相较于一本大学和二本大学，资金来源更加有限。国家对其资金支持相对较少，学校需要通过学费来弥补运营和发展所需的资金。

教育质量和资源投入 ：为了提供良好的教学和研究环境，三本大学需要投入较多的教育资源，包括实验室设备、图书资料、教师培训等方面的费用。这些投入会增加学校的运营成本，从而导致学费相对较高。

市场需求和竞争压力 ：随着高等教育市场的竞争日益激烈，三本大学需要不断提升教学质量和学生就业竞争力，为此需要投入更多的资源和资金。这也是导致学费偏高的一个原因。

教育投资支出不足 ：三本学校的学费基本上只能维持学校的运转和基本支出。教育投资经费的缺乏直接影响了三本大学的教学、科研、师资和设施建设水平。因此，学校也只能依靠提高学费来改善教育环境和教学质量。

普及率低影响办学效益 ：尽管三本学校也想拥有更好的教学品质，但由于高等教育的普及率还不够，导致三本大学的办学规模较小，生源质量比一本、二本更为差距。因此三本大学又不能参与到更多的优质教育资源中，造成了三本学校难以在教育领域分得更多的市场份额。

结构化师资队伍需求不同 ：三本大学对师资队伍的需求与一、二本学校差距较大。三本学校师资队伍要求不仅需要高水平的学术水平，还要求对职业教育的认知领悟与技能储备更为丰富。造成招聘难度大、费用高的问题。

经济压力和考试路数 ：三本学校的学生大多数家庭经济条件普遍较为困难，因此这些学生的经济压力也随之高涨。

商业性经营模式 ：三本大学很多都是民办大学，和公办大学是不一样的。公办大学会有国家的拨款，而民办大学基本都是靠学生的学费来支持学校的一切开销和运作。因此，学费高也是可以被理解的。

综上所述，三本学校学费贵的原因是多方面的，包括资金来源不足、教育质量和资源投入、市场需求和竞争压力、教育投资支出不足、普及率低影响办学效益、结构化师资队伍需求不同、经济压力和考试路数以及商业性经营模式等。