昌吉学院提供了一系列工科专业，旨在培养学生具备实践技能和工程技术知识。以下是学院提供的部分工科专业：

机械设计制造及其自动化

电气工程及其自动化

土木工程

能源与动力工程

材料物理

应用物理学

应用化学

电子信息工程技术

计算机科学与技术

自动化

电子商务

数学与应用数学

化学工程与工艺

材料成型及控制工程

这些专业涵盖了从基础工程到应用技术的广泛领域，为学生提供了多样化的学习和发展机会。