甘肃平行志愿的投档规则如下：

分数优先 ：按照考生的综合成绩（高考成绩加上全国性照顾政策分值）从高到低进行排序，优先投档分数较高的考生。

遵循志愿 ：考生的多个院校志愿有先后顺序，投档时系统会按照考生填报的院校志愿顺序依次进行检索。

一轮投档 ：每个考生在每一批次只能投档一次，一旦投档成功，后续的志愿将不再被检索。若检索到计划未满额的学校，即向该校投档；若所有志愿均未能投档，则该考生在该批次落榜。

具体投档流程为：

首先，根据考生的综合成绩从高到低进行排序，生成排序成绩。

然后，按照排序成绩分科类从高分到低分排定位次。

接着，根据考生的位次优先原则，依次检索其填报的平行志愿。

一旦检索到计划未满额的学校，即向该校投档。

若所有专业投档结束后，考生仍未被录取，将根据其填报的调剂志愿进行调剂投档，直到招生计划完成或考生没有符合要求的调剂志愿为止。

建议在填报志愿时，考生应充分了解各高校的招生计划和自身成绩，合理安排院校志愿的顺序，以提高录取机会。