太原市小店区的小店自主招生初中包括以下几所：

山西省实验中学 ：位于山西省太原市小店区滨河东路铺路，是一所重点初中。

山西大学附属中学 ：位于小店区省府街，是一所一流的中学。

太原市小店第一中学 ：位于小店区小店镇昌盛西街101号。

中辐院学校 ：第三实验中学。

小店区三中教育集团第八中学 。

小店区三中教育集团小店区第六中学校 ：寄宿制学校。

太原市第三实验中学 ：九年一贯直升学校之一。

三十二中 ：九年一贯直升学校之一。

九一实验学校 ：九年一贯直升学校之一。

太原市第二实验中学 ：位于小店区解放南路221号。

太原市第三实验中学（另一所） ：位于小店区环北路188号。

建议家长和学生根据最新的教育政策和学校信息，选择最适合的学校进行申请。