自考本科生在考研时可以选择的院校有很多，以下是一些适合自考生报考的院校：

985/211工程院校

中国海洋大学

四川大学

厦门大学

东北林业大学

西南大学

华中科技大学

西安交通大学

中山大学

东南大学

大连理工大学

其他知名院校

清华大学

北京大学

中国人民大学

北京理工大学

北京航空航天大学

北京科技大学

中国农业大学

天津大学

哈尔滨工业大学

吉林大学

复旦大学

上海交通大学

浙江大学

其他推荐院校

中国矿业大学

南京大学

东南大学

西安电子科技大学

北京交通大学

华北电力大学

西北农林科技大学

重庆大学

西南交通大学

大连海事大学

这些院校在自考考研方面都有较好的口碑和支持，但具体选择还需根据个人实际情况和目标专业来决定。建议考生在选择院校时，综合考虑自身的学习基础、兴趣爱好以及职业规划，选择最适合自己的院校和专业。