根据2025年的最新数据，南通市的大学排名如下表所示。排名主要依据校友会、软科等第三方机构的综合排名数据。

说明：

南通大学是南通市综合实力最强的高校，在全国排名第159位，属于区域一流大学。

南通理工学院和南通大学杏林学院是南通市排名靠前的民办本科院校。

其他院校为专科层次，排名不分先后，数据仅供参考。

如需更详细的信息，可以参考相关机构的排名数据。