菏泽至少有一所农业大学，即 山东农业大学 。山东农业大学是一所具有百年历史的名校，前身是1906年创办于济南的山东高等农业学堂。1952年10月，山东省立农学院与当时的山东大学农学院合并，组成了新的山东农学院，1983年9月，改名为山东农业大学。

此外，菏泽学院也提供与农业相关的专业，如农业科学、植物与动物科学、化学、设施农业科学与工程等。设施农业科学与工程是菏泽学院的特色专业之一，它是一个工学学士学位课程，学制为四年，录取要求是在高考科目中化学、生物和物理任选其一。

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