上海共有11所高校进入前100强，它们分别是：

复旦大学

上海交通大学

同济大学

华东师范大学

上海科技大学

华东理工大学

上海财经大学

海军军医大学

上海大学

上海理工大学

东华大学

这些学校在全国参考排名中位列前茅，其中上海交通大学和复旦大学分别位列全国第4和第5位，同济大学位列第17位，华东师范大学位列第29位，上海科技大学位列第42位，华东理工大学位列第44位，上海大学位列第56位，东华大学位列第76位。

建议：

复旦大学 和 上海交通大学 作为上海的顶尖学府，拥有强大的学术科研能力和人才培养实力，是学生的理想选择。

同济大学 在建筑和土木工程等专业领域具有显著优势。

华东师范大学 作为一所师范类大学，在教育学、心理学等领域有深厚的学术积淀。

上海科技大学 作为一所新兴的高水平研究型大学，发展势头强劲，尤其在科学研究和创新方面表现突出。

华东理工大学 和 上海财经大学 在各自的理工科和财经类专业领域有很高的声誉。

海军军医大学 作为一所军医大学，在医学领域有着重要的地位。

上海大学 和 上海理工大学 在综合性学科和应用型学科方面都有不错的表现。

东华大学 在纺织、材料科学等领域具有传统优势。

这些学校各有特色，学生可以根据自己的兴趣和专业方向选择合适的学校。