高考最难考的大学主要包括 清华大学和北京大学 。这两所大学通常被认为是中国最难考的大学，录取分数线非常高，通常需要全省前百名左右才有较大把握考上。此外， 上海交通大学和复旦大学 、 国防科技大学 、 中国科学院大学 和 中国科学技术大学 等也是高考难度较大的学校。

具体来说，清华大学和北京大学的录取分数线常年居高不下，竞争异常激烈，几乎包揽了全国大部分高考状元。上海交通大学和复旦大学在上海市的招生人数较多，在其他省份招生人数较少，录取分数线也非常高。国防科技大学作为唯一进入“985工程”的军校，并且是“双一流”建设高校，不仅要求高分，还要求学生具备良好的体能和军事训练背景。中国科学院大学和中国科学技术大学在学术圈享有很高的声誉，师资力量强大，科研资源丰富，录取难度同样很大。北京协和医学院作为医学界的顶尖学府，其医学专业的录取难度也非常高。

综合来看，清华大学和北京大学是高考最难考的大学，其他如上海交通大学、复旦大学、国防科技大学、中国科学院大学和中国科学技术大学等也属于高考难度较大的学校。建议学生在报考这些学校时，充分准备，提高自己的综合素质和竞争力。