南通市的绿色学校包括以下学校：

中学 ：

南通市幸福中学

如东县洋口镇初级中学

海安市城南实验中学

小学 ：

南通市通州区姜灶小学

启东市南苑小学

幼儿园 ：

如皋市东皋幼儿园

海门市锦绣幼儿园

高校 ：

南通大学

南通理工学院

江苏航运职业技术学院

江苏工程职业技术学院

南通职业大学

这些学校被认定为绿色学校，意味着它们在环境教育、生态文明理念融入、普及环保知识等方面表现突出。