2025年双鸭山高考540分能上的大学包括：

东北大学 ：最低分数线为536分。

中南财经政法大学 ：最低分数线为535分。

中国地质大学（武汉） ：最低分数线为540分。

中国海洋大学 ：最低分数线为536分。

中国药科大学 ：最低分数线为539分。

北京语言大学 ：最低分数线为539分。

此外，根据2024年的录取数据，540分还可以报考以下大学或专科高职院校：

湖北大学 ：位于湖北，物理类，2024年分数为542分。

天津科技大学 ：具体分数线未提供，但属于本科批。

南京晓庄学院 ：具体分数线未提供，但属于本科批。

重庆医科大学 ：具体分数线未提供，但属于本科批。

石家庄铁道大学 ：具体分数线未提供，但属于本科批。

建议：

东北大学 、 中南财经政法大学 、 中国地质大学（武汉） 、 中国海洋大学 、 中国药科大学 和 北京语言大学 是较为稳妥的选择，因为它们的最低分数线均低于或等于540分。

湖北大学 、 天津科技大学 、 南京晓庄学院 、 重庆医科大学 和 石家庄铁道大学 也是可选的大学，具体分数线和录取情况建议进一步查阅各高校的招生简章和录取数据。