华西口腔医学院的专业设置涵盖了口腔医学的各个方面，具体包括：

基础学科 ：

口腔解剖生理学

口腔组织病理学

口腔预防医学

临床专科 ：

口腔内科学

口腔颌面外科学

口腔修复学

口腔正畸学

儿童口腔病学

口腔放射学

口腔材料学

口腔种植学

口腔生物学

口腔修复工艺学

牙体牙髓病专业

牙周病专业

口腔黏膜病专业

美容外科

美容牙科

医学影像科

X线诊断专业

CT诊断专业

预防口腔专业

这些专业从基础学科到临床专科，旨在培养高素质的口腔医学人才。此外，学院还设有多个交叉学科系和教研室，涵盖了口腔临床医学与口腔基础医学的各个领域，并且拥有国家级精品课程群。