秦朝设置中央政权组织的具体方式如下：

三公的设置 ：

丞相 ：帮助皇帝处理全国的政事，有左右二员，掌管政事。

御史大夫 ：执掌群臣奏章，下达皇帝诏令，兼理国家监察事务。

太尉 ：负责全国军事事务，但职位不常置。

九卿的设置 ：

在三公之下，设立了多个九卿官职，分管国家和皇家各项具体事务，包括郎中令、卫尉、中尉、廷尉、治粟内史、少府、典客、奉常、宗正、太仆等。

地方行政机构 ：

郡县制 ：废除分封制，实行郡县制，将全国划分为36郡（后来增加到40郡），郡下设县，郡守为最高行政长官，郡尉管理治安，郡监执行监察事务。

中央集权 ：

秦朝通过皇帝制度、三公九卿制、郡县制等措施，建立了从中央到地方层层控制的统治体系，强化了封建国家机器。

这些措施共同构成了秦朝中央政权的组织形式，确保了皇权至高无上，地方政权直接隶属于中央政权，从而实现了中央集权的政治体制。