高考化学选做题的选择应基于个人的兴趣、优势和职业规划。以下是针对选修三《物质结构》和选修五《有机化学》的详细分析：

选修三《物质结构》 ：

优点 ：

做题速度快，适合理综考试的时间压力。

各小题之间关联性不强，即使一题不会也不影响其他题目的作答。

缺点 ：

拿到满分几乎不可能，因为每年都会出现一些超纲或难以预料的题目。

大学阶段学习化学专业的实用性不强。

选修五《有机化学》 ：

优点 ：

知识体系完整，体现化学的“变与不变”特点，趣味性强。

有利于解决有机化学的必做题，近年来在高考中占比大。

有利于长远发展，具备实用性。

缺点 ：

需要记忆多种物质的性质，对细心和系统归纳能力要求高。

一个空不会可能导致后面题目都做不出来。

建议

如果你打算填报生化环材等专业 ，选修三可能更有帮助，因为这些专业对物质结构的要求较高。

如果你对有机化学有浓厚的兴趣并且平时做题感觉良好 ，那么选择有机化学可能更适合你，因为这个领域不仅趣味性强，而且具备实用性，有助于解决有机化学的必做题。

如果你对物理有浓厚的兴趣，并且打算选择理工科专业 ，可能需要同时选修物理和化学，因为结构化学题目较为灵活，如果经过训练，可以在短时间内快速作答。

如果你对自己的化学基础有信心，并且愿意挑战更深入的知识点 ，那么可以选择选修四（化学反应原理），这个模块涉及较深奥的概念，如原电池、电解池、化学平衡等，适合对化学有深入理解的学生。

如果你觉得化学学习有困难 ，那么选择相对简单的选修五可能更加适合你。

最终的选择应结合你的兴趣、职业规划以及所在省份的高考化学考试要求。建议在做决定前，多做一些模拟题，了解自己的薄弱环节，并根据自己的实际情况做出选择。