2025年高考毕节539分能上的大学包括以下几所：

贵州工程应用技术学院 ：位居2025毕节市大学排名第一。

毕节职业技术学院 ：位居2025毕节市高职院校排名第一。

广东第二师范学院 ：2024年分数/位次在539分左右，属于本科院校。

武汉工程大学 ：2024年分数/位次在539分左右，属于本科院校。

甘肃政法大学 ：2024年分数/位次在539分左右，属于本科院校。

杭州电子科技大学 ：2024年分数/位次在539分左右，属于本科院校。

东华理工大学 ：2024年分数/位次在539分左右，属于本科院校。

建议：

贵州工程应用技术学院 和 毕节职业技术学院 作为毕节地区的院校，可能更适合本地学生报考。

广东第二师范学院 、 武汉工程大学 、 甘肃政法大学 、 杭州电子科技大学 和 东华理工大学 等本科院校，虽然分数在539分左右，但具体录取情况还需根据各院校的招生计划和考生志愿填报情况进行调整。

建议考生根据自身兴趣和职业规划，综合考虑院校地理位置、专业设置、师资力量等因素，选择最适合自己的大学。同时，建议咨询当地教育考试院或相关高校，获取更准确的录取信息。