高考改革后，实行的是“3+1+2”的考试模式。在这种模式下，第三天主要考的是 选考科目中的两门 。具体来说，第三天上午会考物理或历史中的一门，下午则会考化学或地理、政治中的一门。这样的安排有助于学生更好地安排复习时间，避免在考试当天出现科目冲突。

因此，如果你参加了高考改革后的考试，第三天你需要准备并参加的是你在前两天已经选择的两门选考科目。建议提前查阅当地教育考试机构发布的具体考试安排，以确保不遗漏任何重要信息。