南通大学选专业时，可以参考以下几点建议：

王牌专业

临床医学：国家特色专业建设点和国家一流本科专业，就业前景好，尤其在医疗系统内有广泛的就业机会。

电气工程及其自动化：同样是国家级特色专业和国家一流本科专业，与国网等电力系统有紧密关联，就业前景广阔。

预防医学：国家特色专业，公共卫生和疾病预防领域的重要专业。

英语：语言教育领域具有较高声誉，适合对外交流和外企工作。

热门专业

计算机科学与技术：在IT行业和政府部门有较好就业前景。

环境科学与工程：毕业生在环保企业和政府部门有良好的就业前景。

法学：在律师事务所、法院等法律机构有良好就业前景。

生物工程：在生物制药、生物检测等领域有较好就业前景。

其他重点专业

机械工程及自动化：在工业自动化控制方面有着重要地位，就业形势良好。

自动化：工业自动化控制领域的重要专业。

体育教育：作为师范类专业，培养体育教师，前景广阔。

药学：在医药领域有广泛应用。

电子信息工程：工学领域中具有广泛应用前景。

选科要求

首选物理，再选不限：适用于汉语言文学师范等师范类专业、秘书学、应用统计学、高分子材料与工程、电气工程及其自动化、通信工程等工程专业。

首选物理，再选化学：适用于化学师范、交通工程、交通设备与控制工程、纺织工程等工程专业。

首选物理，再选化学或生物：适用于临床医学和口腔医学等专业。

首选历史，再选不限：适用于汉语言文学师范等专业、秘书学、思想政治教育师范等专业。

个人兴趣和发展方向

选择自己感兴趣的专业，有助于长期的学习动力和未来的职业发展。

了解所选专业的课程设置，看是否符合自己的学术兴趣和学术发展方向。

参考最新的就业数据和专业排名，做出更加明智的选择。

综上所述，南通大学的专业选择应综合考虑个人兴趣、专业声誉、就业前景及选科要求。王牌专业和热门专业如临床医学、电气工程及其自动化、预防医学和计算机科学与技术等都是不错的选择。建议学生根据自己的兴趣和发展方向，仔细研究各专业的课程设置和就业前景，做出最适合自己的选择。