徐州医药高等职业学校的专业设置涵盖了多个领域，主要包括以下专业：

药学类专业 ：

药学

中药学

药物制剂技术

生物制药技术

中药制药技术

药品生产技术

药品质量与安全

制药设备应用技术

药品经营与管理

护理类专业 ：

护理

助产

护理（中高职4+2）

康复治疗技术类专业 ：

康复治疗技术

医疗器械类专业 ：

医用电子仪器技术

医疗器械维护与管理

医疗设备应用技术

生物制药与制药设备类专业 ：

生物制药技术

制药设备应用技术

药品质量与安全类专业 ：

药品质量与安全

药品经营与管理类专业 ：

药品经营与管理

其他类专业 ：

药物分析技术

化学制药技术

食品药品监督与管理

生产过程自动化技术

这些专业旨在培养技术技能型紧缺人才，涵盖了从基础药学知识到具体制药技术、护理技能、康复治疗技术、医疗器械操作与维护以及药品质量与安全等多个方面。学校不仅注重理论教育，还强调实践技能的培养，与多家医疗机构和制药企业建立了合作关系，为学生提供实习和就业机会。