南菁高中的自主招生是指 高校在统一高考基础上，通过自主选拔考试，选拔出具有一定学科特长和创新潜质的优秀毕业生 。具体来说，南菁高中会拿出一定比例的招生名额，在高考的基础上，通过院校的综合评价体系（包括笔试和面试考核），选拔出具有学科特长和创新潜质的优秀学生。最终获得拟录取资格的考生在高考成绩达到院校标准时，可在高考录取中享有一定的投档及专业录取优惠。

此外，自主招生还可以通过签订招生考试合同，使考生享受降低十分至几十分录取的优惠政策，同时可能获得专业选择方面的优惠。这种招生方式是对现行统一高考招生按分数录取的一种补充，旨在选拔和培养优秀创新人才，为中国高等教育的发展提供多元化的录取途径。

对于南菁高中而言，自主招生也是选拔培养具有创新潜质、学科特长、较高综合素质的初中优秀毕业生的一种方式，有助于学校实现其教育目标和培养创新人才的战略。