云南高考期间下雨的原因主要有以下几点：

季风气候影响 ：云南地处季风气候区，夏季东南季风带来暖湿气流，导致降水增多。高考通常在6月上旬进行，正值夏季风盛行时期，因此降雨概率较大。

雨季影响 ：云南的雨季通常从6月开始，高考时间刚好与雨季重叠，因此出现降雨的情况较为常见。

气候变化 ：气候变化可能导致天气异常，降雨可能超出预期。高考期间下雨可能是气候变化的一个表现。

天气系统影响 ：冷暖气团的相互作用等天气系统也可能导致高考期间出现降雨。

人工降雨 ：为了缓解高温对考生的影响，有些地方可能会采取人工降雨的措施，从而在一定程度上影响了高考期间的天气状况。

综上所述，云南高考期间下雨主要是由于季风气候、雨季、气候变化、天气系统影响以及可能的人工降雨等多种因素共同作用的结果。尽管降雨可能会给高考的组织工作和考生带来一定的困扰，但通过提前预警和周密的应对措施，可以最大限度地减轻其负面影响。