农业水利工程专业主要涵盖以下专业方向：

灌溉工程 ：研究如何科学利用水资源进行节水抗旱，包括灌溉渠道系统的规划设计和水资源汇集利用等。

排水工程 ：探讨农田水分过多的原因及相应的排水方法。

农业土木工程 ：侧重于农业基础设施的建设。

农业机械化工程 ：研究农业生产的机械化。

农业水土工程 ：关注农业水土资源的合理利用和保护。

港口及航道专业 ：涉及港口和航道的规划、设计、施工和维护。

水利水电工程 ：侧重于大型水利工程，如水电站等。

热能与动力工程 ：在农大水院中，热能方向尤其是水轮机方面的研究排在全国前列。

农业建筑环境与能源工程 ：培养具备建筑、设施农业工程、农村新能源开发与利用等方面的基本理论知识和专业技能的高级复合型应用人才。

水利工程 ：研究灌排工程学、水文学、水力学和工程力学等方面的基本知识和技能，以农业灌溉为主，也涉及到城市和工业用水领域，进行水利工程的勘测、规划、设计等。

水工建筑物 ：研究各类水利工程建筑物的设计、施工和管理。

水利工程施工 ：研究水利工程的施工方法、施工组织和管理。

灌溉与排水工程学 ：研究农业灌溉和排水的理论、技术和方法。

水资源规划利用与管理 ：研究水资源的合理规划、利用和管理。

水文学 ：研究水在自然界中的循环过程、分布、运动规律及其与各种自然现象和人类活动的关系。

工程力学 ：研究工程结构在受到外力作用下的应力、应变、破坏及其防治方法。

水力学 ：研究液体在静止和运动状态下的力学特性及其在工程中的应用。

土力学 ：研究土体的物理、力学性质及其在工程中的应用，包括地基处理、边坡稳定等。

结构力学 ：研究工程结构在受到外力作用下的稳定性、强度和刚度等问题。

钢筋混凝土结构 ：研究钢筋混凝土材料的力学性能、设计方法和施工工艺。

土壤农作学 ：研究土壤的性质、分类、改良及其在农业生产中的应用。

这些专业方向不仅涵盖了农业水利工程的核心内容，还涉及到相关领域的知识和技能，旨在培养能够从事农业水利工程勘测、规划、设计、施工、管理和科研等方面工作的高素质拔尖创新型人才和复合应用型人才。