学校的公章通常由以下部门管理：

学校办公室 ：作为综合管理部门，负责保管和使用学校行政公章、校领导法人章、校长签字章等。

行政管理部门 ：可能包括人事处、财务处、后勤管理处等，具体负责哪些公章可能因学校而异。

教学管理部门 ：如教务处、教研室等，可能负责教务科公章、教研室公章等。

党委和纪委 ：分别负责党委公章和纪委公章。

工会和团委 ：分别负责工会公章和团委公章。

总务科 ：可能负责总务科公章，涉及学校日常事务和物资管理。

校长法人章和校长签字章 ：由校长本人或其授权的人员负责。

建议：

了解具体规定 ：不同学校可能有不同的行政管理架构和公章管理流程，建议先咨询学校相关部门或查阅学校内部规章制度，以明确具体负责部门。

正式使用 ：在使用公章时，务必确保符合学校规定和流程，避免因操作不当导致的法律或行政问题。