新疆昌吉地区在高考中使用的试卷类型如下：

全国Ⅱ卷 ：

新疆在2020年之前使用全国Ⅱ卷，即新课标二卷，也称为全国甲卷。

全国乙卷 ：

2023年和2024年新疆高考使用的是全国乙卷。

因此， 新疆昌吉地区在高考中使用的试卷类型是全国Ⅱ卷或全国乙卷 。具体使用哪一套试卷，可能会根据教育部考试中心的安排和当年的高考政策有所调整。建议关注新疆教育考试院或相关官方渠道的最新公告，以获取最准确的信息。